Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pole2O54956 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pole2O54956 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole2O54956 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole2O54956 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole2O54956 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole2O54956 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole2O54956 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms