Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms