Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NlkO54949 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NlkO54949 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NlkO54949 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NlkO54949 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NlkO54949 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NlkO54949 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NlkO54949 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NlkO54949 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NlkO54949 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NlkO54949 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NlkO54949 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NlkO54949 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NlkO54949 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NlkO54949 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NlkO54949 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NlkO54949 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NlkO54949 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NlkO54949 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NlkO54949 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NlkO54949 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NlkO54949 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NlkO54949 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NlkO54949 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NlkO54949 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NlkO54949 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NlkO54949 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NlkO54949 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NlkO54949 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NlkO54949 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NlkO54949 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NlkO54949 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NlkO54949 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NlkO54949 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NlkO54949 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NlkO54949 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NlkO54949 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NlkO54949 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NlkO54949 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NlkO54949 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NlkO54949 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NlkO54949 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NlkO54949 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NlkO54949 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NlkO54949 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NlkO54949 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NlkO54949 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NlkO54949 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NlkO54949 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NlkO54949 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NlkO54949 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NlkO54949 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NlkO54949 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NlkO54949 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NlkO54949 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NlkO54949 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NlkO54949 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NlkO54949 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NlkO54949 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NlkO54949 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NlkO54949 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NlkO54949 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NlkO54949 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NlkO54949 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NlkO54949 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NlkO54949 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NlkO54949 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NlkO54949 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NlkO54949 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NlkO54949 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NlkO54949 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NlkO54949 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NlkO54949 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NlkO54949 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NlkO54949 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NlkO54949 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NlkO54949 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NlkO54949 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NlkO54949 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NlkO54949 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NlkO54949 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NlkO54949 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NlkO54949 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NlkO54949 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NlkO54949 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NlkO54949 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NlkO54949 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NlkO54949 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NlkO54949 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NlkO54949 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NlkO54949 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NlkO54949 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NlkO54949 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NlkO54949 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NlkO54949 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NlkO54949 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NlkO54949 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NlkO54949 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NlkO54949 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NlkO54949 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms