Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itgb3O54890 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Itgb3O54890 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Itgb3O54890 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Itgb3O54890 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms