Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DffbO54788 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffbO54788 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffbO54788 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffbO54788 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffbO54788 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffbO54788 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffbO54788 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffbO54788 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffbO54788 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffbO54788 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffbO54788 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffbO54788 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffbO54788 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffbO54788 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffbO54788 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffbO54788 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffbO54788 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DffbO54788 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffbO54788 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffbO54788 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffbO54788 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffbO54788 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffbO54788 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffbO54788 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffbO54788 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffbO54788 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffbO54788 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffbO54788 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffbO54788 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffbO54788 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffbO54788 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffbO54788 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffbO54788 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffbO54788 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffbO54788 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffbO54788 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffbO54788 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffbO54788 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DffbO54788 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DffbO54788 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DffbO54788 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DffbO54788 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DffbO54788 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DffbO54788 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DffbO54788 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DffbO54788 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DffbO54788 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
DffbO54788 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DffbO54788 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffbO54788 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffbO54788 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffbO54788 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DffbO54788 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffbO54788 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffbO54788 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffbO54788 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffbO54788 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DffbO54788 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffbO54788 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffbO54788 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffbO54788 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffbO54788 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffbO54788 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffbO54788 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffbO54788 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffbO54788 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffbO54788 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffbO54788 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DffbO54788 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DffbO54788 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DffbO54788 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DffbO54788 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DffbO54788 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DffbO54788 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DffbO54788 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DffbO54788 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DffbO54788 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DffbO54788 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DffbO54788 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DffbO54788 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DffbO54788 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DffbO54788 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DffbO54788 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DffbO54788 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DffbO54788 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffbO54788 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffbO54788 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffbO54788 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffbO54788 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffbO54788 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffbO54788 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffbO54788 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffbO54788 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffbO54788 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffbO54788 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffbO54788 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffbO54788 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffbO54788 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffbO54788 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms