Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CrxO54751 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CrxO54751 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CrxO54751 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CrxO54751 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CrxO54751 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CrxO54751 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CrxO54751 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CrxO54751 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CrxO54751 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CrxO54751 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CrxO54751 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CrxO54751 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CrxO54751 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CrxO54751 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CrxO54751 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CrxO54751 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CrxO54751 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CrxO54751 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CrxO54751 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CrxO54751 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CrxO54751 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CrxO54751 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CrxO54751 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CrxO54751 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CrxO54751 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CrxO54751 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CrxO54751 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CrxO54751 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CrxO54751 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CrxO54751 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CrxO54751 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CrxO54751 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CrxO54751 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CrxO54751 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CrxO54751 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CrxO54751 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CrxO54751 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CrxO54751 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CrxO54751 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CrxO54751 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CrxO54751 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CrxO54751 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CrxO54751 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CrxO54751 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CrxO54751 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CrxO54751 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CrxO54751 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CrxO54751 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CrxO54751 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CrxO54751 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CrxO54751 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CrxO54751 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CrxO54751 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CrxO54751 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CrxO54751 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CrxO54751 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxO54751 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxO54751 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxO54751 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxO54751 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CrxO54751 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxO54751 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxO54751 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxO54751 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxO54751 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxO54751 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxO54751 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxO54751 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxO54751 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxO54751 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CrxO54751 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxO54751 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxO54751 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxO54751 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxO54751 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxO54751 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxO54751 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxO54751 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxO54751 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxO54751 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxO54751 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxO54751 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxO54751 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxO54751 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CrxO54751 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxO54751 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxO54751 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxO54751 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxO54751 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxO54751 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxO54751 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxO54751 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxO54751 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxO54751 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxO54751 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxO54751 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxO54751 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CrxO54751 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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