Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EdaO54693 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EdaO54693 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EdaO54693 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EdaO54693 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EdaO54693 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EdaO54693 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EdaO54693 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EdaO54693 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EdaO54693 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EdaO54693 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EdaO54693 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EdaO54693 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EdaO54693 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EdaO54693 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EdaO54693 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EdaO54693 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EdaO54693 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EdaO54693 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EdaO54693 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EdaO54693 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EdaO54693 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EdaO54693 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
EdaO54693 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EdaO54693 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EdaO54693 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EdaO54693 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EdaO54693 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EdaO54693 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EdaO54693 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EdaO54693 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EdaO54693 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EdaO54693 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EdaO54693 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EdaO54693 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EdaO54693 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EdaO54693 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EdaO54693 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EdaO54693 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EdaO54693 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EdaO54693 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EdaO54693 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EdaO54693 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EdaO54693 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EdaO54693 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EdaO54693 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EdaO54693 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EdaO54693 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EdaO54693 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EdaO54693 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EdaO54693 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EdaO54693 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EdaO54693 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EdaO54693 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EdaO54693 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EdaO54693 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EdaO54693 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EdaO54693 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EdaO54693 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EdaO54693 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EdaO54693 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EdaO54693 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EdaO54693 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EdaO54693 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EdaO54693 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EdaO54693 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EdaO54693 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EdaO54693 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EdaO54693 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EdaO54693 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EdaO54693 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EdaO54693 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EdaO54693 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EdaO54693 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EdaO54693 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EdaO54693 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EdaO54693 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EdaO54693 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EdaO54693 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EdaO54693 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EdaO54693 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EdaO54693 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EdaO54693 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EdaO54693 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EdaO54693 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EdaO54693 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EdaO54693 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EdaO54693 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EdaO54693 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EdaO54693 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EdaO54693 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EdaO54693 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EdaO54693 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EdaO54693 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EdaO54693 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EdaO54693 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EdaO54693 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EdaO54693 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EdaO54693 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EdaO54693 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms