Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3cdO35904 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms