Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfibp2O35711 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms