Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms