Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk3O35492 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk3O35492 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk3O35492 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk3O35492 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clk3O35492 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clk3O35492 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clk3O35492 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Clk3O35492 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms