Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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TnxbO35452 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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TnxbO35452 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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TnxbO35452 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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TnxbO35452 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TnxbO35452 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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TnxbO35452 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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TnxbO35452 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TnxbO35452 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TnxbO35452 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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TnxbO35452 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TnxbO35452 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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TnxbO35452 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TnxbO35452 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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TnxbO35452 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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TnxbO35452 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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TnxbO35452 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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TnxbO35452 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TnxbO35452 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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TnxbO35452 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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TnxbO35452 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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TnxbO35452 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TnxbO35452 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TnxbO35452 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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