Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms