Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dgcr6O35347 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dgcr6O35347 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dgcr6O35347 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dgcr6O35347 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dgcr6O35347 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dgcr6O35347 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Dgcr6O35347 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dgcr6O35347 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dgcr6O35347 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dgcr6O35347 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dgcr6O35347 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Dgcr6O35347 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dgcr6O35347 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dgcr6O35347 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dgcr6O35347 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dgcr6O35347 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dgcr6O35347 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dgcr6O35347 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dgcr6O35347 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dgcr6O35347 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dgcr6O35347 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dgcr6O35347 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms