Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna4O35343 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms