Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f3O35261 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
E2f3O35261 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f3O35261 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f3O35261 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2f3O35261 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2f3O35261 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2f3O35261 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms