Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Polr1aO35134 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms