Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms