Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Q1O19441 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms