Protein–RNA interactions for Protein: O08917

Flot1, Flotillin-1, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flot1O08917 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Flot1O08917 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Flot1O08917 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Flot1O08917 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Flot1O08917 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Flot1O08917 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Flot1O08917 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Flot1O08917 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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