Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eftud2O08810 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms