Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec22bO08547 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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