Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms