Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2035J3QP87 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2035J3QP87 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2035J3QP87 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2035J3QP87 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2035J3QP87 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2035J3QP87 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2035J3QP87 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2035J3QP87 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2035J3QP87 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2035J3QP87 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2035J3QP87 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2035J3QP87 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2035J3QP87 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2035J3QP87 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2035J3QP87 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2035J3QP87 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm2035J3QP87 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm2035J3QP87 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm2035J3QP87 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Gm2035J3QP87 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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