Protein–RNA interactions for Protein: J3QNQ5

Btbd35f24, BTB domain-containing 35, family member 24, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f24J3QNQ5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Btbd35f24J3QNQ5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Btbd35f24J3QNQ5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Btbd35f24J3QNQ5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Btbd35f24J3QNQ5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f24J3QNQ5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms