Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21972J3QN38 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21972J3QN38 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21972J3QN38 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21972J3QN38 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21972J3QN38 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21972J3QN38 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21972J3QN38 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21972J3QN38 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21972J3QN38 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21972J3QN38 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21972J3QN38 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21972J3QN38 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms