Protein–RNA interactions for Protein: J3QMN6

Fmo6, Flavin-containing monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmo6J3QMN6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Fmo6J3QMN6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fmo6J3QMN6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms