Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms