Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Cldn34c3J3QJW5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Cldn34c3J3QJW5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Cldn34c3J3QJW5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.05■□□□□ 0
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