Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Gm21818J3KMS6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21818J3KMS6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21818J3KMS6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Gm21818J3KMS6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm21818J3KMS6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21818J3KMS6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21818J3KMS6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm21818J3KMS6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21818J3KMS6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21818J3KMS6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21818J3KMS6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21818J3KMS6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21818J3KMS6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21818J3KMS6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21818J3KMS6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21818J3KMS6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21818J3KMS6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21818J3KMS6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21818J3KMS6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm21818J3KMS6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm21818J3KMS6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21818J3KMS6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm21818J3KMS6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm21818J3KMS6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm21818J3KMS6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21818J3KMS6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21818J3KMS6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21818J3KMS6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21818J3KMS6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21818J3KMS6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21818J3KMS6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21818J3KMS6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21818J3KMS6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21818J3KMS6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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