Protein–RNA interactions for Protein: H3BKF4

Gm20708, Predicted gene 20708, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20708H3BKF4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms