Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tubgcp6G5E8P0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tubgcp6G5E8P0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tubgcp6G5E8P0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tubgcp6G5E8P0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tubgcp6G5E8P0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tubgcp6G5E8P0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tubgcp6G5E8P0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Tubgcp6G5E8P0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tubgcp6G5E8P0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tubgcp6G5E8P0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tubgcp6G5E8P0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tubgcp6G5E8P0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tubgcp6G5E8P0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Tubgcp6G5E8P0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tubgcp6G5E8P0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tubgcp6G5E8P0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tubgcp6G5E8P0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tubgcp6G5E8P0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tubgcp6G5E8P0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms