Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U1

Obox6, Oocyte specific homeobox 6, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox6G3X9U1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Obox6G3X9U1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms