Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf148G3X9R7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms