Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms