Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
BicraF8VPZ9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms