Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ercc6F8VPZ5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ercc6F8VPZ5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms