Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ttc37F8VPK0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ttc37F8VPK0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms