Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms