Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp988F6VKC7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp988F6VKC7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp988F6VKC7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp988F6VKC7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp988F6VKC7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp988F6VKC7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp988F6VKC7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Zfp988F6VKC7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp988F6VKC7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp988F6VKC7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp988F6VKC7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp988F6VKC7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp988F6VKC7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Zfp988F6VKC7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp988F6VKC7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp988F6VKC7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp988F6VKC7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp988F6VKC7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp988F6VKC7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp988F6VKC7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Zfp988F6VKC7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Zfp988F6VKC7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Zfp988F6VKC7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Zfp988F6VKC7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Zfp988F6VKC7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Zfp988F6VKC7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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Zfp988F6VKC7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Zfp988F6VKC7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp988F6VKC7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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