Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sptbn5F6UCX4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms