Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf212F6TQD1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms