Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms