Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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