Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms