Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8N6

Aknad1, AKNA domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aknad1E9Q8N6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aknad1E9Q8N6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms