Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdhr2E9Q7P9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdhr2E9Q7P9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdhr2E9Q7P9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdhr2E9Q7P9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms