Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Urb2E9Q7L1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Urb2E9Q7L1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms