Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6W0

BC030500, cDNA sequence BC030500 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030500E9Q6W0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC030500E9Q6W0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC030500E9Q6W0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC030500E9Q6W0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC030500E9Q6W0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BC030500E9Q6W0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC030500E9Q6W0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC030500E9Q6W0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC030500E9Q6W0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC030500E9Q6W0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC030500E9Q6W0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC030500E9Q6W0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC030500E9Q6W0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC030500E9Q6W0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC030500E9Q6W0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC030500E9Q6W0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC030500E9Q6W0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC030500E9Q6W0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC030500E9Q6W0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC030500E9Q6W0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC030500E9Q6W0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC030500E9Q6W0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC030500E9Q6W0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms