Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Simc1E9Q6E9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms